2009年秋天，深圳中学2007级学生 罗亦龙 年仅16岁，召集了17名同学，决心创办一本「真正属于学生」的独立刊物。那个年代，深中正处于王铮校长主导的教育改革黄金期：取消班主任、实行导师制与单元制、走课制、选课制——学生获得了空前的自主空间。
2009年11月23日，编辑部正式成立。12月9日，第一期《涅槃周刊》出刊。彼时它只是三张报纸的篇幅，免费发放。但即便这最初的三页纸上，便已经刊登了对 《华尔街日报》驻京记者、2001年普利策奖得主 Ian Johnson 的专访，以及对 深中校长王铮 的深度对话。
更特别的是——这一切，校方事先毫不知情。
尽管名为「周刊」，实际从双周报纸逐步演变为月刊杂志，以 黑色封面 为标志性视觉风格。每期最少36页，最多超过90页。
涅槃周刊始终坚持 三个"独立"：不接受校方拨款、编辑内容不受审查、财务自负盈亏。这在中国学生媒体中极为罕见。
深度校园调查报道——每一期的"头条"
师生人物特写、深度访谈
校园亚文化讨论、现象透视
学生评论与"读者辩论"——刊登对立观点
诗歌、摄影、创意作品（后期增设）
涅槃周刊拒绝校方拨款，从第6期开始以 每本3元 的价格发售。此前5期均为免费派发，转为收费的决定源于一场读者调查。
📌 第3期起：刊登商业广告
📌 第4-5期起：摄影棚出租广告
📌 第8期起：商业摄影服务
📌 第12期起：广告制作服务
📌 淘宝店铺：第6期宣布开设、第13期刊登地址
📌 校园卡读卡器：第4期申请，用于接受捐款
所有财务完全公开——每期杂志都会附上 详细财务报表，供读者监督。创始副主编 罗晓韵 是团队唯一年满18岁的成员，由她开设银行账户管理编辑部资金。印刷则依靠一位同学家庭经营的印刷厂，以近乎零利润的价格承印。
涅槃不仅在深圳中学校内发行，还通过各校驻校代理网络，覆盖了珠三角多所名校：
深圳外国语学校、深圳实验学校、深圳高级中学、红岭中学
广东省实验中学（广州）
南头中学、北师大附中
面向全国读者的包邮配送服务
2010年3月，涅槃周刊联合深中《新深中》、深圳外国语《缪斯》、深圳高级中学《深视野》成立 「深圳高中生纸质媒体协会」，后红岭中学《消化》加入。同年约9月，广州广东省实验中学的学生甚至尝试在当地建立涅槃分部。
此外，《光明日报》/《文摘报》（2011年11月22日）也进行了转载报道。涅槃周刊一度成为国内外关注中国中学生公民社会实践的标本。
涅槃周刊的诞生与发展，深嵌于深圳中学那场被教育部称为「抓住了课改灵魂」的改革之中。
2003年，废除班主任制度，推行导师制、单元制、走课制、选课制。学段制、连堂排课、过程性学业评价、学长团(2004)、心智训练(2006)。创建凤凰木论坛(2003)、社团联盟(2003)、内宿委员会(2003)、膳食委员会(2006)。
校训："深圳中学致力于培养个性鲜明、充满自信、敢于负责，具有思想力、领导力、创造力的杰出公民。"
2010年初，王铮离任，王占宝（原南京师大附中）接任。涅槃周刊第6期以 90余页篇幅 推出特刊「王的更迭——深中的前世今生」，被视为这本刊物的巅峰之作。
王占宝恢复班主任制度、减少选课自由度，引发学生社群激烈讨论。2010年"周末留宿事件"中，学校取消周末留宿，学生发起静坐抗议——涅槃周刊全程报道，校方最终撤回决定。
2012年，罗善文在涅槃发表万言书《我，深中，教书育人》，王占宝随后召开两天"圆桌会议"与学生媒体对话。
"涅槃"，意为凤凰浴火重生。这个名字既是对深中改革精神的隐喻，也是对学生媒体使命的自我期许：
涅槃周刊的核心信念是：在一所中学里，学生完全有能力像真正的媒体那样运作——自主采编、自负盈亏、不回避争议、不依附权力。这不仅是一本杂志，更是一场关于「学生能做什么」的社会实验。
2016年6月26日，涅槃周刊通过微信公众号发布停刊声明。刊物的纸质版被 深圳中学图书馆特藏室 永久收藏。数字化档案由校友志愿维护，目前正在由纪念刊筹备组推进 线上档案库 的建设。
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